2023 Հեղինակ: Sophia Otis | [email protected]. Վերջին փոփոխված: 2023-05-21 01:49
WALNUT CREEK - Հետազոտողների խումբը մեկ օրվա ծանրաբեռնվածության ընթացքում բացահայտել է վնասակար բակտերիայի ողջ գենոմը, որը կոչվում է «սուպերբակտերիա», որը հիվանդանոցային վարակների հիմնական պատճառն է::
Ջանքերն ավարտեցին գենոմի հաջորդականության առաջին փուլը (որսորդական հրացանի հաջորդականության փուլը) մինչև այն մակարդակը, որը բավարար էր օրգանիզմի հիմնականում բոլոր գեների նույնականացման համար:
Enterococcus faecium-ի գենոմը, որը հայտնի է որպես սուպերբակտ, քանի որ հակաբիոտիկների նկատմամբ իր դիմադրողականությունն է, հաջորդականացվել է Էներգետիկայի դեպարտամենտի Համատեղ գենոմի ինստիտուտում (JGI) Walnut Creek, Ca.:
Նախագիծը JGI-ի համագործակցությունն էր՝ Էլբերտ Բրենսկոմբի և Թրևոր Հոքինսի գլխավորությամբ, և Ջորջ Վայնստոքի և Բարբարա Մյուրեյի՝ Տեխասի համալսարանի առողջապահության գիտական կենտրոնից և Հյուսթոնի Բեյլորի բժշկության քոլեջից։
«Սա Էներգետիկայի դեպարտամենտի գենոմի միացյալ ինստիտուտի տեխնոլոգիական հմտության հիանալի ցուցադրումն է», - ասաց էներգետիկայի նախարար Բիլ Ռիչարդսոնը: «Միկրոբների ԴՆԹ-ն արագ վերծանելու այս նոր հնարավորությունը կարող է օգտագործվել գիտական հանրությանը կյանքի և մանրէաբանական աշխարհի մասին հսկայական թվով հիմնարար տվյալներ տրամադրելու համար: Այս տեղեկատվությունը թույլ է տալիս ուսումնասիրել հիվանդություն առաջացնող բակտերիաները, ինչպես նաև բակտերիաները, որոնք կարող են: մաքրել շրջակա միջավայրը և օգուտ քաղել մեզ շատ այլ առումներով»:
Աշխատանքները բակտերիաների ԴՆԹ-ի գրադարանների հաջորդականացման և զարգացման վրա ֆինանսավորվել են Էներգետիկայի դեպարտամենտի և Ալերգիայի և վարակիչ հիվանդությունների ազգային ինստիտուտի կողմից:
ԴՆԹ-ի 2,8 միլիոն բազային զույգերը, որոնք կազմում են E. faecium-ի գենոմը, հաջորդականացվել են՝ օգտագործելով մեկ օրվա արտադրական հզորությունը JGI's Sequencing Facility-ում:
«Ես ասում էի, որ «մենք կարող ենք բակտերիաների հաջորդականությունը մեկ օրվա ընթացքում», - ասում է JGI-ի տնօրեն Էլբերտ Բրանսքոմը: «Այսպիսով, երբ Ջորջը (Վայնստոկ) ինձ հարցրեց, թե արդյոք մենք կարող ենք օգնել իրեն այս պաթոգենների վրա իրենց աշխատանքում, մենք օգտվեցինք հնարավորությունից և՛ ցուցադրելու ունակությունը, և՛ օգտակար ծառայություն մատուցելու բժշկական համայնքին: Պարզապես հարմարության համար մենք տարածեցինք աշխատանքը: երկու օր անընդմեջ, բայց մենք օգտագործեցինք միայն մեկ օրվա հնարավորությունը առաջադրանքը կատարելու համար:
«Կարծում եմ, որ արագ արձագանքման այս տեսակ կարողությունը կարող է շատ օգտակար լինել բժշկական, ազգային անվտանգության և գյուղատնտեսական համատեքստերում հետազոտողների համար», - ավելացրեց Բրանսքոմը:
Զինված բակտերիայի գենոմի ամբողջական հաջորդականությամբ՝ բժշկական հետազոտողներն այժմ կարող են աշխատել օրգանիզմի խոցելիությունը գտնելու և այն սպիտակուցի դեմ ուղղված պատվաստանյութերի դեմ ուղղորդելու ուղղությամբ, ասել է Բեյլոր քոլեջի Մարդու գենոմի հաջորդականության կենտրոնի համատնօրեն Վայնստոկը: Բժշկություն.
«Հետազոտական այս առաջընթացը ճանապարհ է հարթում կանխարգելիչ պատվաստանյութերի համար, ի լրումն ավելի լավ ախտորոշիչ թեստերի և բուժումների», - նշել է Վայնստոկը:
Վերջին 20 տարիների ընթացքում E. faecium-ով և այլ էնտերոկոկներով վարակները կտրուկ աճել են: Էնտերոկոկներն այժմ ԱՄՆ-ում հիվանդանոցային վարակներից մեկուսացված երկրորդ ամենատարածված պաթոգենն է, ասել է Ուայնստոկը:
Վերջերս նկատվել է E. faecium-ի կողմից աճող դիմադրություն վանկոմիցինի հակաբիոտիկի նկատմամբ, որը սովորաբար համարվում է բուժման վերջին բուֆերը, ինչպես նաև մի շարք այլ միջոցների նկատմամբ::
«Դիմադրության աճը լուրջ ազդանշան է հակաբիոտիկների արդյունավետության նվազման մասին», - ասաց Վայնստոկը:
Հիվանդանոցային պաթոգենները, ինչպիսիք են E. faecium-ը, ավելի մեծ ազդեցություն են ունեցել արդյունաբերական զարգացած երկրներում, ինչպիսիք են ԱՄՆ-ը, հատկապես երկարատև հիվանդանոցում գտնվելու, բազմաթիվ հակաբիոտիկների և մի շարք բժշկական խնդիրներ ունեցող հիվանդների վրա, ինչպիսիք են քաղցկեղը կամ Նախքան վիրահատությունը, ասել է Բարբարա Մյուրեյը՝ Տեխասի Հյուսթոնի համալսարանի բժշկական դպրոցի ձևավորվող և նորից առաջացող պաթոգենների ուսումնասիրության կենտրոնի Վայնստոքի հետ համատեղ տնօրենը:
Վերջերս հաջորդականացված բակտերիան կարող է տարածվել ամբողջ մարմնով և կարող է առաջացնել լուրջ վարակներ արյան, սրտի, միզուղիների, կենտրոնական նյարդային համակարգի և վերքերի մեջ:
Մինչ օրս հայտնաբերվել են միայն մի քանի նոր հակաբիոտիկներ փորձանոթային հետազոտություններում, որոնք խոստումնալից են այն օրգանիզմների դեմ, ինչպիսին E. faecium-ն է, ասել է Վայնստոկը:
«Արդյունքում, այս օրգանիզմի հիմնարար հատկությունների ուսումնասիրությունը, ամենայն հավանականությամբ, կարևոր դեր կխաղա էնտերոկոկային վարակների բուժման, կանխարգելման կամ փոփոխման նոր միջոցների հայտնաբերման գործում», - ասաց Վայնստոկը::
JGI-ում և Բեյլորի բժշկության քոլեջում ապագա աշխատանքը կավարտի E. faecium գենոմի վերջնական հավաքումը և կապահովի դրա գենետիկ կառուցվածքի ավելի ամբողջական վերլուծություն:
Գենոմի միացյալ ինստիտուտը ստեղծվել է 1997 թվականի հունվարին՝ միաձուլելով Լոուրենս Բերքլիի, Լոուրենս Լիվերմորի և Լոս Ալամոսի ազգային լաբորատորիաների նախկինում գոյություն ունեցող գենոմի ծրագրերը։
Քանի որ JGI-ն ստանձնեց իր նոր օբյեկտի զբաղեցումը 1999 թվականի հունվարին, այն ավելացրել է իր արտադրության տեմպերը ավելի քան 20 անգամ՝ հասնելով մոտավորապես 25 միլիոն հումքի օրական՝ էապես հաստատուն բյուջեով, ասել է Բրանսքոմը::
Հիմնադրվել է 1952 թվականին, Լոուրենս Լիվերմորի ազգային լաբորատորիան բազմապրոֆիլ, ազգային անվտանգության լաբորատորիա է, որը գիտությունն ու տեխնոլոգիան կիրառում է մեր ժամանակի կարևոր խնդիրների համար: Լաբորատորիան կառավարվում է Կալիֆորնիայի համալսարանի կողմից՝ ԱՄՆ էներգետիկայի նախարարության համար:
